明清時期戴莊為戴姓家族田莊，清嘉慶道光年間為著名畫家戴鑑（字賦軒，號石坪）的“椒花村舍”，后屬清郎中李澍，極盡營造，“獨擅一時亭園之盛”。

1879年李氏四世孫李善虎將“藎園”賣給德國傳教士安治泰，成為兗州教區的“避靜山莊”、圣言會傳教活動的基地。同時在藎園內建立西醫衛生室，吸引教民，“戴莊醫院”最早起源于這個時期。

1884年德國傳教士安治泰和奧地利傳教士福若瑟在戴莊建立了濟寧地區第一所西醫醫院天主教會醫院，這是“戴莊醫院”有記載的歷史開始。

1897年11月巨野教案后清政府被迫簽訂《中德膠澳租借條約》，用其中賠款白銀6.6萬兩在此修建教堂，開辦醫院、學校。

1948年7月濟寧第二次解放，濟北縣政府駐扎此處，在教會醫院的基礎上建立濟北縣醫院和軍隊醫院；1951年3月濟北縣政府和縣醫院遷往任城二十里鋪；

1950年3月魯中南第二療養院與泰安第一療養院合并為魯中南療養院，5月遷至戴莊天主教堂西院內；

1951年8月魯中南療養院遷出至滕縣代廟村，同時抽調人員組建山東省第四康復醫院（綜合醫院，600張床位）接管戴莊；

1952年8月1日山東省精神病康復醫院成立，床位100張，專門收治抗美援朝戰場上的精神神經病患者；

1952年9月27日收治第一批精神病員54人；

1952年11月開始開展心理治療；

1953年8月更名為山東省康復醫院管理局第十一康復醫院；

1953年10月床位擴至200張；

1953年12月首次開展電休克治療；

1954年4月接收山東省第三康復醫院轉來病員100人；

1955年醫院與第四康復醫院合并，更名為第四康復醫院，設固定床位400張；

1955年11月成立司法精神病鑒定小組，開始精神病司法鑒定工作；

1956年10月，按中央指示，住院的現役軍人，集體辦理復員手續；

1956年11月按衛生廳（56）第26號文，更名山東省戴莊醫院，床位增加至450張；

1960年4月起，對濟寧市進行神經癥調查；

1960年5月1日，醫院更名為山東省戴莊精神病防治院，簡易病房設床位100張；

1961年10月起，對濟寧菏澤兩地進行神經癥調查；

1960年11月醫院各項規章制度匯編《醫院工作手冊》；

1962年起擔負濟寧醫專、兗州醫士學校神經精神疾病教學實習見習工作；

1963年12月醫院主辦全省學術年會；

1964年4月，《精神科手冊》、《精神病護理手冊》編制成書；

1966年8月醫院成立文革領導小組，更名濟寧工農兵醫院，文化大革命在醫院開始；

1973年4月醫院第四次修訂《醫院管理和工作制度》；

1979年9月神經科獨立建科，10月27日開始收治神經科住院病人；

1979年10月20日醫院更名為山東省濟寧地區精神病院；

1980年8月醫院成立護校，面向社會招生，1984年7月停辦；

1984年濟寧地改市，更名為濟寧市精神病防治院。

1985年1月30日門診部開展心理咨詢工作；

1989年5月16日施行第一例腦立體定向手術；

1992年市干部療養院并入市精神病防治院，并建立濟寧市職業病醫院；

1995年建立濟寧醫學院附屬第二醫院；

2002年2月省公安廳衛生廳批準成立山東省安康醫院戒毒所，設床位300張；

2007年8月國家發改委公安部司法部批準建立山東省公安戒毒康復中心；

2011年1月國家發改委項目山東省（濟寧）公安戒毒康復中心大樓竣工使用；

2011年司法精神病鑒定科獲得國家認監委頒發的資質認定審查認可證書和國家認可委頒發的檢查機構認可證書；

2012年5月恢復“山東省戴莊醫院”名稱；

2014年12月18日通過三級甲等精神病醫院評審。

2019年7月通過三級甲等精神病醫院復審。

2020年被評為山東省省級精神專科區域醫療中心。

2020年精神科再次被評為省級區域重點專科。

2020年榮獲智慧門診服務品牌。

2020年榮獲年度優質服務單位榮譽稱號。

2021年6月正式更名為山東省戴莊醫院、山東省安康醫院、濟寧市精神衛生中心
2022年12月“精神病與精神衛生學”成為省衛健委“十四五”期間首批醫藥衛生重點學科，“濟寧市精神疾病精準醫療實驗室”成為濟寧市重點實驗室。